Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930513O06RikQ9D549 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms