Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 292.9 ms