Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm20lQ9D4V6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm20lQ9D4V6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms