Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ribc2Q9D4Q1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ribc2Q9D4Q1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ribc2Q9D4Q1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms