Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh2Q9D489 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms