Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933421I07RikQ9D420 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms