Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms