Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms