Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed3Q9D0L1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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