Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms