Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms