Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms