Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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