Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms