Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms