Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sycp2Q9CUU3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Sycp2Q9CUU3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms