Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
4930535I16RikQ9CUI2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms