Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snw1Q9CSN1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snw1Q9CSN1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms