Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prps2Q9CS42 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prps2Q9CS42 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms