Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc43Q9CR29 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc43Q9CR29 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms