Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PsenenQ9CQR7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms