Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Smim8Q9CQQ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Smim8Q9CQQ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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