Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms