Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DenrQ9CQJ6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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