Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab5aQ9CQD1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab5aQ9CQD1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab5aQ9CQD1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab5aQ9CQD1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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