Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl39lQ9CQD0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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