Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms