Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Chmp3Q9CQ10 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms