Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Commd4Q9CQ02 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd4Q9CQ02 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms