Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cmc1Q9CPZ8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms