Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce3Q9CPR8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce3Q9CPR8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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