Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim26Q99PN3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim26Q99PN3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms