Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms