Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim8Q99PJ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms