Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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