Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GpnmbQ99P91 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GpnmbQ99P91 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms