Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl3Q99N95 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms