Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms