Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkd1Q99MH6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms