Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp4Q99ME9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms