Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncaipQ99ME3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms