Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nus1Q99LJ8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms