Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp16Q99LG0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms