Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gps1Q99LD4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms