Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms