Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms