Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rab28Q99KL7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rab28Q99KL7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rab28Q99KL7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rab28Q99KL7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rab28Q99KL7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rab28Q99KL7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rab28Q99KL7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab28Q99KL7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab28Q99KL7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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