Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp11Q99K46 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms