Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TrabdQ99JY4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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TrabdQ99JY4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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TrabdQ99JY4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TrabdQ99JY4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TrabdQ99JY4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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