Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GatbQ99JT1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GatbQ99JT1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms